Управление Школой осуществляется в соответствии с Законом РФ «Об образовании» и Типовым положением об общеобразовательном учреждении на принципах демократичности, открытости, приоритета общечеловеческих ценностей, охраны жизни и здоровья человека, свободного развития личности, единоначалия и самоуправления.
Высшим органом самоуправления МКОУ «Хабайдакская ООШ» (далее –Учреждение) является общее собрание трудового коллектива (далее – Конференция), реализующая принцип государственно-общественного характера управления образованием.